（1）抗酸剂和抗分泌剂：
（1）抗酸剂：在治疗消化不良的药物中，抗酸剂是应用最广泛的药物之一。它在西方国家是一种非处方药，一些病人使用抗酸剂后症状得到缓解，但也有报道称抗酸剂和安慰剂在治疗功能性消化不良方面的疗效相似。
中国常用的抗酸剂（碳酸氢钠、氢氧化铝、氧化镁、三硅酸镁）有罗耐、复方氢氧化铝（胃得安）、胃得安（乐得安）、碳酸铝镁（胃得安）和复方铝酸铋。这些药物对缓解饥饿感、反酸、烧心和其他症状比较有效。但药物的作用时间较短，必须多次服用，而长期使用则容易出现不良反应。
②抗分泌药物。抗分泌药物主要是指H2受体拮抗剂和质子泵抑制剂。
关于H2受体拮抗剂治疗功能性消化不良的报道很多，从统计学上看，药物的疗效明显优于安慰剂。主要有西咪替丁，20至30毫克/（公斤-日），分两次口服；雷尼替丁，5至7毫克/（公斤-日），分两次口服；法莫替丁，0.6至1毫克/（公斤-日），分两次口服。
质子泵抑制剂奥美拉唑，0.6至0.8mg/(kg-d)，分1次口服，可抑制壁细胞H+-K+-ATP酶，对酸分泌有较强的抑制作用，持续时间长，适用于H2受体拮抗剂治疗失败的患者。
