十二条经络中的每一条都有五个具体的穴位，从四肢末端到肘部或膝部：井、荥、输、京、合，统称为 "五穴"。这是以水流的大小来描述每条经络气的特点，由小到大，由浅到深。"出者为井，溜者为荥，注者为输，行者为精，入者为和，二十七气之流，皆在五腧"。(《灵枢?(九针十二原》）意思是说，气从四肢末端向上作用于头部和躯干，像水一样由小到大，由浅入深，气从开始出来，就像水的源头，所以叫 "井"，多位于四肢爪甲的一侧。经络之气初出，如水之源，故称 "行"，多位于指（趾）掌心。经络之气逐渐充盈，如水之大流，故称 "输"，多位于腕（踝）关节附近。经络之气饱满，如水之长流，故称 "经"，多位于腕（踝）或臂（胫）关节处。重点是经气深，像水的汇流，所以叫 "合"，多位于肘（膝）附近。
这五个穴位在治疗疾病方面有各自的特点。井穴开窍醒神，可用于精神错乱、心下烦闷；涌泉穴清泻邪火，可用于发热；输液穴可用于发作性疾病和关节疼痛；井穴可用于喘咳和咽喉疾病；合穴可用于肠胃等六腑。这就是《灵枢?顺气之日》分为四次。"病在藏，取井；病在色，取荥；病在时，取输；病在声，取精；精满则病在胃，饮食不节而得，取合。"以及《难经》中给出的补充解释？六十八难》中给出的补充解释。"井主心下满，荥主身热，输主重节痛，精主喘咳，寒热，何主逆气泄。"灵枢?邪气臧否》将其概括为："辛、藿治外经，和治内府"。这就是说，各条经络的荥穴和输穴治疗外经的疾病，而合穴治疗六腑的疾病。
井穴也是十二经脉的 "根 "穴，因为它们位于四肢的末端，便于临床诊断和治疗。
合穴是五个穴位中的最后一个，位于肘关节和膝关节附近。大肠、小肠、三焦六腑在足三阳经上还有一个合穴，称为下合穴。灵枢?邪气藏病》中说："荥阳为外经，内府。这指的是六腑。 " 这是因为 "大肠和小肠都属于胃"，所以它们的穴位在足阳明胃经上；三焦的水道源于膀胱，所以它们的穴位在足太阳膀胱经上；六腑下的穴位是 "入内的阳脉，属于府"，这在临床上对治疗 它们在临床上对治疗 "脏腑 "是有帮助的。而其他的新兴穴和输液穴则用于治疗各条经络的外感疾病。
