艾滋病患者多出现明显的消瘦和严重的营养不良，贫血，白细胞，血小板或全血细胞减少。
长期腹泻引起水电解质紊乱，神经系统的损伤引起智力下降，反应迟钝，抑郁，忧虑，类妄想狂精神病或痴呆。
心血管系统的损伤引起心动过速，心脏增大，充血性心力衰竭。
肾功能的损伤可引起间质性肾炎和肾小管坏死，出现蛋白尿，少尿，高度水肿，氮质血症及肾功能衰竭。
肌肉骨骼系统的损伤可引起游走性关节炎，关节疼痛和关节腔积液，酷似风湿性关节炎，抗风湿治疗效果不佳，亦可表现有多发性肌炎，肌肉明显压痛及活动障碍，肌肉活检呈坏死性肌炎。
内分泌系统的损伤可出现肾上腺功能不全和低肾素血症，低血压，持续性低血钠和高血钾，甲状腺功能低下，糖尿病和肾上腺危象等。
