1.持续时间长。减敏疗法需要用很长时间，舌下脱敏疗法一般两年，皮下注射脱敏疗法至少三年。皮下注射脱敏疗法前半年每周一次，而后两周一次到最后的一月一次，否则的话会前功尽弃或者需要花更多的时间来治疗过敏性鼻炎。
2.对药物浓度的不耐受。 舌下脱敏是每天用药，不耐受情况较为轻微。皮下注射脱敏是将过敏原注射进患者体内使产生耐受力，因此可能会有全身反应，患者注射后半小时应该留在医院观察，以便有紧急情况如呼吸急促、皮肤红肿发痒能尽快处理。
3.过敏个体差异比较大，临床有效率在80%。减敏疗法并非能够100%根治过敏性鼻炎，但是是目前唯一一个治本的方法。
4.在脱敏治疗期间如果有过敏症状需要及时配合控制症状的药物治疗。 如果减敏疗法情况稳定，只需要做注射治疗就好，如果天气骤变或感冒了，在加以药物以及局部治疗。
5,起效比较慢。 由于脱敏治疗至少需要坚持两年，一般起效时间是3-9个月。
