过敏性咳嗽病的发病原因错综复杂，但主要包括两个方面，即过敏性咳嗽病患者的体质和环境因素。患者的体质包括“遗传素质”、免疫状态、精神心理状态、内分泌和健康状况等主观条件，是患者易感过敏性咳嗽的重要因素。环境因素包括各种变应原、刺激性气体、病毒感染、居住的地区、居室的条件、职业因素、气候、药物、运动(过度通气)、食物以及食物添加剂、饮食习惯、社会因素甚至经济条件等均可能是导致过敏性咳嗽发生发展的更重要原因。过敏性咳嗽病发病率的增高趋势也与患者的过敏性体质导致的易感性和环境因素有关。
从单合子双胞胎在过敏性咳嗽发病中的不一致性来看，环境因素在过敏性咳嗽的发病中可能具有重要作用。环境中变应原的接触对于患者过敏性咳嗽基因的表达往往是必需条件，环境中变应原的浓度经常可以决定过敏性咳嗽基因的表达水平。
现代医学认为过敏性咳嗽病患者气道变应性炎症的形成为诸多因素综合作用的结果，临床工作者应分清主次因素，才能有的放矢地开展防治工作。此外病人初次接触上述不良环境因素的年龄、不良环境的恶劣程度、接触的频率以及接触持续的时间也是决定病人是否由过敏性咳嗽前状态转变为过敏性咳嗽病的重要因素，同时也是决定过敏性咳嗽病患者预后和转归的关键因素。在日常生活中某些诱发过敏性咳嗽的环境因素如尘螨、真菌、花粉等变应原、病毒和气候变化等往往持续存在而较难避免，加上随着现代生活水平的提高，新的过敏源频频进入人们的生活领域，人们出差、旅行、度假等机会也增多，活动地域在不断扩大，所以过敏原的接触范围也增大，因此过敏性咳嗽病的防治往往较为困难，防不胜防。
目前多数作者认为应把引起过敏性咳嗽病的诸多因素分为致病因素(Trigger)和诱发因素(Contributor)两大类，致病因素是指引起过敏性咳嗽病首次发作的因素，是过敏性咳嗽病发病的"扳机"和主要病因，无论在过敏性咳嗽病的发生和发展中均起重要作用;诱发因素是指病人在已患有过敏性咳嗽病的基础上诱发隐性过敏性咳嗽重新活动或过敏性咳嗽急性发作的因素，是过敏性咳嗽发作过程中的综合诱发因素之一，在促使过敏性咳嗽病情复发和进一步发展中起重要作用。
在上述两大类因素中，某些因素如变应原、刺激性气体和有害气体、职业性因素、病毒、食物和药物等兼有双重作用，既可导致过敏性咳嗽病的发生，又在过敏性咳嗽病情的发展过程中起重要作用。然而，我们应当明确所有的环境因素并非是决定过敏性咳嗽病是否发生的唯一因素，过敏性咳嗽病患者本身的特应性素质也是非常重要的。
