首先，应加强检查，尤其是胃镜检查。若发现大肠化生及重度胃黏膜不典型增生，应根据临床症状，3～6个月做一次胃镜活检，以早期发现，决定是否需要手术治疗。定期胃镜随访很重要，尤其对伴有息肉、异型增生者或有局灶性凹陷或隆起者，并在胃镜下作多点活检，对胃黏膜很光滑的轻度萎缩性胃炎，可适当拉开随访间期。
在观察治疗期间，应减少刺激性食物，多食奶制品及含大量维生素的新鲜蔬菜，严禁酗酒及暴饮暴食，少吃腌熏食品。
西药对该病的治疗多以缓解症状为主，尚无特效药物。中医近几年由于开展了这方面的研究取得了较为注目的成就，展示出中医治疗本病的广阔前景。经过中医药或中西医结合治疗本病，患者的肠上皮化生和萎缩性病变大都可出现逆行性好转。中医认为，本病病位在胃、脾，其病机是脾胃升降失调，气机紊乱造成本虚标实，本虚是指脾胃气虚、阳虚或阴虚，标实是指气滞、湿阻、火郁、血瘀，脾胃中虚、气滞不畅又是本病的病理基础。
总之，对该病治疗应以中医药或中西医结合治疗为主，对手术问题要慎重，因为手术后的残胃也很容易发生肠化生和癌变。
