自十九世纪末以来，肝活检仍然是评估肝脏疾病的病因和程度的标准检测。目前，经皮穿刺活检主要由胃肠病/肝病科医师或放射科医师进行。
肝活检通常是安全的，且目前被认为是评估肝脏炎症和纤维化的标准检测，但不可避免的存在抽样误差，罕见并发症，偶尔会引发患者明显的焦虑情绪。上述因素导致人们对肝纤维化的非侵入性检测开发产生了浓厚的兴趣。非侵入性检测兑现了减少肝活检需要的承诺，但大多数肝脏学家认为其临床应用比较有限。当前可用的测试在检测慢性肝病中间阶段进展时，结果存在差异。而且，这些检测方法尚缺乏验证，也是其潜在的缺点之一。以下为肝活检的适应症及禁忌症。
适应症
肝活检，联合病史及体检资料，是诊断及治疗肝脏疾病的有效临床工具。根据临床问题，获取活检标本的适应症如下：
1、异常肝实验室检查结果；
2、确认诊断和预测；
3、可疑肝肿瘤；
4、胆汁淤积性肝病诊断；
5、浸润性或肉芽肿性疾病评估；
6、肝移植术后评估和管理排斥反应；
7、评估不明原因的黄疸或可疑药物反应。
活检标本可用于识别或排除躯体或实验室异常的可能病因。不同的疾病可能表现为相同的状态，可以在临床表现背景下使用诊断组织学模式。例如，肝实质脂肪浸润可能存在于由于酒精滥用、丙型肝炎、糖尿病、肥胖等导致的疾病。对于每种疾病状态，组织学线索可以将它们区分开来。
肝活检的另一个用途是测定活检标本中组织学改变的程度。这涉及到病理学家指出的肝脏炎症及纤维化程度评分系统。大多数评分系统使用分级报告炎症的程度，使用分期报告纤维化程度。例如，中度炎症反应（3级）与肝硬化（4期）。
第三种情况是监测疾病的进展或治疗效果。例如，肝活检标本经常被用于评估及治疗肝移植术后的排斥反应。重复活检较少用于监测疾病的进展，如原发性胆汁性肝硬化、慢性丙型肝炎或酒精性肝病。
禁忌症
肝活检的禁忌症如下:
1、凝血酶原时间（PT）延长，国际标准化比值(INR)＞1.6；
2、血小板减少症，血小板计数＜60,000/μL；
3、腹水(首选经颈静脉途径)；
4、困难体型(优先选择经颈静脉途径)；
5、疑似血管瘤；
6、疑似内包虫感染；
7、不合作的患者。
