口腔不可能成为一个无菌的环境，也不能把所有的细菌都消灭。因为消灭细菌之后，又会有真菌袭来，造成更严重的、很难控制的后果。因此我们必须坚持不懈地与牙菌斑作斗争，使这些“社区”维持在一个较低数量，防止“社区”发展壮大，甚至最终钙化，形成牙石。当牙石形成之后，使用日常口腔护理的方法是不能清除掉的，只能寻求专业人士的帮助，用专门的器械清除。
清除牙菌斑和打扫房间类似，墙缝及各种缝隙往往是最难清洁的地方，而牙齿的“缝隙”一个是牙与牙龈之间，一个是牙与牙之间，清洁不同的部位需要用到不同的方法。
牙与牙龈之间
刷牙
刷牙是众所周知的口腔护理方法，也是清除牙菌斑最基本和最主要的方法。首先要坚持早晚刷牙，而晚上刷牙尤其重要。牙面上的食物残渣没有及时清除，为细菌提供了极其丰富的营养物质，细菌可以大量增殖，同时产生更多的有害物质，而睡眠中，唾液分泌减少，不能很好地中和、稀释这些有害物质，因而会对牙齿造成严重的危害。
1、关于牙刷、牙膏的选择
牙刷一般建议选用软毛牙刷，避免对牙齿或牙龈造成损伤，而近年来含药物的牙膏种类较多，主要功效有防龋、抑菌、止血、脱敏及减轻口臭等。但药物仅起辅助作用，主要靠机械清扫作用，正如洗衣服时，洗衣粉只起辅助作用，关键在于揉搓。
2、刷牙的方法
刷牙的方法有数十种之多，关键在于牙刷到位，面面俱到。现仅介绍最常用的水平颤动法(又称Bass法)。
一般的方法刷牙后，在牙齿与牙齿之间常余留菌斑，需要用其他方法来补充，来清除残留的菌斑。根据牙缝的大小不同可以使用牙线、牙签或间隙刷。
