附睾囊肿的治疗用药在临床上多选用广谱抗生素及对革兰氏阴性菌效果较佳的抗生素。对于疼痛、发热等全身症状，应用解热镇痛药对症处理。
如果附睾疼痛较重可请专科医师予1%利多卡因10～20毫升由睾丸上端处行精索局部封闭，可起到止痛、解除坠胀作用。
如果附睾炎性包块增大，阴囊皮肤红肿且有波动感，形成脓肿则须行切开引流。因留置导尿管招致本病者，应拔除尿管。另外，急性期期间附睾囊肿的治疗要避免性冲动和重体力活动，以免加重感染和症状。对少数顽固病人且病情控制不理想，可行附睾甚至包括睾丸切除术。
黄连素或新霉素离子透入，附睾囊肿的治疗单用抗生素往往治疗效果满意，如附睾炎反复发作引起前列腺炎应在非发作期行输精管结扎术，前列腺炎可治愈，有时也可行附睾切除术。
如果慢性附睾炎有多次反复发作者，可考虑做附睾切除。值得重视的是，无论急性还是慢性附睾炎，如为双侧发生，均有导致不育的可能，故发生附睾炎应及时治疗。
其实附睾囊肿发生之后对人体的健康造成一些不好的方面的，其中积极的治疗才是最关键的，一些祖传秘方也是能够很好的治疗附睾囊肿的，那么祖传治附睾囊肿的偏方希望上面介绍的治疗办法对患者有益。
