脱水和电解质紊乱：腹泻时机体不仅不能有效地从食物中吸收水份和电解质，而且还会以肠液的形式将它们进一步丢失。所以腹泻时，如果不能及时有效地补充水份和电解质的话，就会出现不同程度的脱水和电解质紊乱。其中，电解质紊乱包括低钠、低钾、低钙和低镁，它们不仅不利于疾病的恢复，而且还会给孩子带来不必要的痛苦，例如低钾可引起顽固性的腹胀，低钙可引起手足抽搦或惊厥。
病毒性心肌炎：它发生在肠道病毒感染所致的腹泻之后，腹泻使患儿的抵抗力进一步下降，病毒就可侵犯心脏而引起病毒性心肌炎。并发此病的患儿会有胸闷、胸痛、心悸、头晕、乏力等症状。重症患儿会因为严重的心律失常导致心力衰竭、心源性休克，甚至危及生命。
肠套叠：婴儿常见的急腹症之一，多见于4～10个月的婴儿。随着年龄的增长，发病率逐渐降低。绝大多数婴儿肠套叠是原发性的，只有2%～8%的病例为继发性。由于肠蠕动失去正常节律性，肠环肌发生持续性局部痉挛，肠近端剧烈蠕动，遂将痉挛的肠段推入远端肠腔内。腹泻和伴随它的病毒感染是引起肠套叠的主要原因，应当引起警惕。
营养不良：多发生在迁延性腹泻或慢性腹泻之后。营养不良会使患儿的抵抗力进一步下降，易继发各种感染，如鹅口疮、支气管肺炎、结核病、中耳炎、尿路感染等，而且腹泻迁延不愈还会加重营养不良，造成恶性循环。
