其主要病因为阴道菌群失调。也可见于性接触传播，被污染的衣物用具，消毒不合格的卫生巾、卫生纸、护垫。
霉菌有许多种，在人体最主要的为白色念珠菌属。霉菌阴道感染 80%～90%系白色念珠菌引起，其余是其他念珠菌和球拟酵母菌属，故霉菌性阴道炎实际上即念珠菌阴道炎或阴道念珠菌病。白色念珠菌呈卵圆形，由芽生孢子及细胞发芽伸长形成假菌丝，假菌丝与孢子相连成分枝或链状。念珠菌通常是一种腐败物寄生菌，可生活在正常人体的皮肤、黏膜、消化道或其他脏器中，在阴道中存在而经常无症状。当阴道糖原增加、酸度升高时，或在机体抵抗力降低的情况下，便可成为致病的原因，长期应用广谱抗生素和肾上腺皮质激素，可使霉菌感染大为增加。因为上述两种药物可导致机体内菌群失调，改变了阴道内微生物之间的相互制约关系，抗感染的能力下降。此外，维生素缺乏(复合维生素B)、严重的传染性疾病，和其他消耗性疾病均可成为白色念珠菌繁殖的有利条件。妊娠期阴道上皮细胞糖原含量增加，阴道酸性增强，加之孕妇的肾糖阈降低，常有妊娠期糖尿病，小便中糖含量升高而促进白色念珠菌的生长繁殖。
