一般来说，在早上的时候，人体经过一个晚上的休息，白天的机体消耗已经恢复，身体机能最旺盛，且已经长时间未进食，急需补充能量。因而，这时候肠胃等消化系统的消化吸收能力是最强的，且这时候吸收的蛋白质不必用于恢复机体，会累积到机体，建议早上食用蛋白粉。
中午的时候，一上午的工作学习，消耗了大量能量，肚子饿了，人体急需补充能量，有进食需求，消化吸收旺盛。但这时跟早上不能相比，这个时候吸收的蛋白质，一部分用于恢复身体机能，另一部分用于补充能量，剩下的才会用于机体累积。此外，有的人午餐吃得比较丰盛，再补充蛋白粉就多余了，消化不了就是浪费啦。而蛋白质缺乏者，往往是食欲食量都小，午餐都不够能量消耗，蛋白粉补充进去也是被用作能量消耗了。所以，中午不是最好的补充蛋白粉的时机。
晚上的时候，由于白天的工作学习等活动虽然消耗了人体的物质，也急需补充能量，但是这个时候消化系统能力也是最弱的，加上休眠后，消化活动会很低。所以，晚上食用蛋白粉，有一部分被人体利用补充能力了，另一部分没能吸收，被浪费掉了。
有些人选择晚上睡前食用蛋白粉，以提高睡眠质量。至于是否真能提高睡眠质量，这个因人而异。但是，如果有肠胃病史，或是肠胃病正在治疗或是恢复期，晚上最好不要食用蛋白粉，此时肠胃消化活动和功能随着休眠也大幅降低，否则会加重肠胃负担，更不利于肠胃恢复。
人体空腹的时候，摄取的食物最优先是用来满足人体能量需求的，然后才是用于机体修复和累积。因而，不要空腹食用蛋白粉，否则会被人体当作能量物质来消化了，浪费蛋白质啦。最好是餐后办小时再食用,一般早晨后30分钟食用即可。如果急着工作等，没空等待，可以先吃完了其他食物再食用蛋白粉即可。
如果是运动员、健身和健美者，由于高强度运动会消耗肌蛋白，对肌肉不利，这就不能拘泥于什么时候是最合适了，必须在运动后补充蛋白质，因而，他们可以在运动后半小时食用蛋白粉，以防止蛋白质不足损伤肌肉。
对于素食者和节食减肥者，可以每一顿都适量补充蛋白粉。素食者和节食减肥者往往存在蛋白质不足的问题，因而，建议在日常饮食中每餐都补充一定的蛋白补充剂。饭后或是饭后半小时食用蛋白粉即可。
对于婴幼儿和身体成长期的青少年，以及营养不足者和需要少食多餐老年人与病人，可以在白天的就餐中每一顿都补充适量的蛋白粉，以弥补人体蛋白不足，促进人体生长或是恢复。饭后或是饭后半小时食用即可。
