1、病因治疗
找到引起闭经的器质性疾病，给予适当治疗。例如，结核性子宫内膜炎要进行抗结核治疗。宫腔粘连的病人应扩张宫腔，放置节育器，防止再次粘连。对于垂体或卵巢肿瘤，诊断明确后，根据肿瘤的部位、大小、性质确定治疗方案，选择手术、放疗、化疗等综合措施。
2.性激素替代疗法
对于先天性卵巢发育不良，或因卵巢功能受损或破坏而导致的早衰，可采用激素替代疗法。它通常用于性激素的人工周期治疗。应用性激素后，出现类似月经的周期性撤退性出血，一方面纠正患者的生理和心理状态，另一方面促进生殖器官和第二性征的一定程度的发育。
（1）小剂量雌激素周期疗法 作用是促进垂体功能，分泌黄体生成素，使卵巢分泌雌激素增加，促进排卵。
（2）雌激素和孕激素序贯疗法 作用是抑制丘脑下部-垂体轴，停药后可恢复月经，并有排卵。
（3）雌激素和孕激素联合治疗 作用是抑制垂体促性腺激素，停药后偶有反弹作用，而月经恢复和排卵发生。口服避孕药每晚一次，从月经的第五天开始，停药22天。第二个疗程从下一次月经的第五天开始，共3至6个周期。
(4) 诱导排卵 如果卵巢功能没有衰竭，且患者需要生育，可使用激素或其类似物诱导排卵：（1）在垂体功能不全时，使用从绝经后妇女尿液中提取的卵泡成熟激素（hMG）诱导卵泡发育和分泌雌激素。与与垂体黄体生成素相似的绒毛膜促性腺激素（hCG）相结合，可以促进卵泡成熟导致排卵，并促进黄体的形成和发展。(2）性功能低下时，卵巢和垂体反应正常，而丘脑下部功能不足或不协调，即用氯喹促进丘脑下部促性腺激素释放激素的分泌，纠正其功能，诱发排卵。
