HBV-DNA：即是乙肝病毒的脱氧核糖核酸（即乙肝病毒基因）。 HBV-DNA是HBV感染最直接、特异性强和灵敏性高的指标，HBV-DNA阳性，提示HBV复制和有传染性。HBV-DNA越高表示病毒复制越厉害，传染性强。
病毒从结构上分为两类，一类是RNA病毒（核糖核酸病毒），另一类是DNA病毒（脱氧核糖核酸病毒），乙肝病毒属于后者。病毒与细菌不同，细菌体内含有两种核酸（RNA和DNA），而病毒体内只含有一种核酸，或RNA或DNA。核酸是病毒的核心部分，病毒的基因都在这里，没有核酸，病毒就不能复制。
HCV-RNA：是检测丙型肝炎病毒脱氧核糖核酸。在HCV急性感染期，在血浆或血清中的病毒基因组水平可达到105～107拷贝/ml。
HCV基因组为一长的开放读码框架（ORF），在其两侧的5′和3′均有非编码区，从5′端开始，编码区由7个基因区组成，即C、E1、E2、NS1、NS2,NS3、NS4和NS5，C区编码核衣壳蛋白，E1区和E2/NS1区编码包膜蛋白。包膜区基因是基因组变异最大的部分，故迄今HCV感染者几乎均检测不到对HCV的中和抗体可能与此有关，也可能是引起HCV易持续感染和疾病慢性化的一个原因。NS2～NS5编码非结构蛋白，其中有的功能还不很清楚。NS3编码螺旋酶和蛋白酶，NS3蛋白抗原性强，产生的抗体具有重要诊断价值。NS5编码依赖RNA的RNA多聚酶，NS5蛋白抗体阳性似乎与病毒活动有关。
