①葡萄球菌败血症。由于金黄色葡萄球菌中能产生β-内酰胺酶的菌株已达90%左右，所以青霉素G对其效果很差，而第一代和第三代头孢菌素对β-内酰胺酶的作用有不同程度的抑制，对其敏感的菌株可达90%，所以头孢噻吩、头孢唑啉、头孢噻肟、头孢哌酮/舒巴坦等。现在经常使用，也可以 阿米卡星、庆大霉素和万古霉素联合治疗耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌是首选。
②革兰氏阴性杆菌败血症：氯霉素、氨苄青霉素，现在普遍耐药，第三代头孢菌素对这些细菌有较强的抗菌活性，敏感率一般大于90%，第二代头孢菌素对大肠杆菌和S.pneumoniae，所以对这类败血症可选择第二代和第三代头孢菌素，可与庆大霉素或阿米卡星合用，也可与哌拉西林合用。头孢克肟应用于铜绿假单胞菌败血症时效果不佳，以头孢哌酮、头孢哌酮/舒巴坦为好，或上述药物与氨基糖苷类抗生素合用，疗效也不错，氧氟沙星。环丙沙星等喹诺酮类药物对包括铜绿假单胞菌在内的G型细菌有较强的抗菌活性，且受外界影响小，与其他类型的抗菌药物未见交叉耐药性，副作用轻，也是临床上常用的。在临床上也常被选用。
③厌氧菌败血症：常为复数细菌混合感染，选药时应考虑到兼职厌氧菌或需氧菌，常选药物有氯霉素、万古霉素、林可霉素、克林霉素、羧苄青霉素、氨苄青霉素、头孢氨苄、头孢曲松、甲硝唑、替硝唑、环丙沙星和氧氟沙星。
④真菌性败血症：本病在20世纪50年代曾用两性霉素B治疗，它具有很强的抗真菌作用，但由于其毒副作用而限制使用。20世纪80年代以来，出现的咪康唑（Dakine）是一种合成的1-苯乙基咪唑衍生物，对念珠菌、曲霉菌、隐球菌等。具有较强的抗菌性，不必与其他抗真菌药物合用，可静脉注射，也可囊内、鞘内、外伤等多途径给药，氟康唑（大扶康）是一种新型的三唑类抗真菌药物，能特异性地有效抑制真菌甾醇的合成，与血浆蛋白结合率低，能渗透到体液中，有静脉注射和口服两种剂型，虽然上述两种药物有一定毒副作用，患者仍能耐受。在重要脏器功能条件的监护下，现在应用较为广泛，当真菌和细菌感染同时存在时，选药极为困难，杀灭细菌，真菌泛滥，抑制真菌，细菌就会成灾，大蒜注射液可以同时控制真菌和细菌的生长，建议使用，但效果较弱，对严重感染往往不起作用。
