1、疾病类型不同：
毛囊炎是细菌性皮肤病，完全是因外界细菌感染皮肤毛囊而产生毛囊疾病;而痤疮是皮肤附属器病，是由身体内部病变引发皮肤受损的，内部疾病是“肇事者”，皮肤受损是“受害者”。
2、病因不同：
毛囊炎发病原因简单，为凝固酶阳性金葡菌感染引起，是皮肤表面的原因，与身体内部是否病变无关;痤疮发病原因复杂，感染细菌丙酸杆菌只是次要原因，主要原因来自身体内部内分泌系统失衡，与雄性激素、皮脂腺分泌旺盛、毛囊皮脂异常角化及遗传等因素有关。
3、好发部位不同：
毛囊炎好发于面部、颈部、臀部及四肢等易与衣物发生摩擦的部位;痤疮好发于面颊、额部，其次是胸部、背部及肩膀部等皮脂分泌旺盛的部位。
