控制性超排卵的并发症：目前，辅助生育界根据病人的卵巢储备、年龄、不孕病人的病史等资料来估计病人对促排卵药的反应性，以此设计控制性超排卵方案。但是由于当前评估卵巢反应的技术还很不完善，因此控制性超排卵方案的设计有时会不尽人意，高估或低估的情况有时会发生。这一过程有可能发生如下并发症和/或副作用，而影响体外受精-胚胎移植的进一步治疗。
1、促性腺激素释放激素激动剂（GnRHa）的副作用
目前，在设计控制性超排卵方案时，一般要用GnRHa抑制垂体，防止内源性LH峰发生，以提高妊娠率。但是，GnRHa的使用可能导致下列副作用：
（1）卵巢激活：若只有几个卵泡激活，经B超穿刺后，则可继续进行；若多个卵泡激活，则本周期取消；
（2）垂体抑制不全：若发生，则增加GnRHa剂量，继续治疗；如果增加剂量后，仍然抑制不全，则需停止治疗；
（3）一般注射GnRHa的时间从黄体中期开始（月经来潮前），由于此时不能可靠的诊断是否妊娠，因此有可能在妊娠期误用GnRHa，导致胎儿暴露于GnRHa中，产生无法预知的影响。
2、促性腺激素释放激素拮抗剂的副作用
促性腺激素释放激素拮抗剂的主要作用是抑制垂体，防止内源性LH峰发生，以提高妊娠率。但是，在某些特殊情况下会发生垂体抑制不全的状况。如果经过常规处理后，仍然无法改善，则取消本周期。
3、卵巢过度刺激综合症（OHSS）
临床上主要表现为恶心、呕吐、腹胀、腹水、胸水、卵巢增大、电解质紊乱等症状。重度OHSS可危及生命，其发生率约为0.5-5％左右。为避免这一结果发生，医生会加强对卵巢的监测，但即使如此OHSS仍难以完全避免。若发生，本周期将根据具体情况决定是否取消。
4、发生过早LH峰和过早排卵
是指卵泡在发育成熟前过早出现LH峰或排卵。即使是在促排卵过程中常规使用抑制排卵的药物，少数病人仍会发生过早出现LH峰或排卵。发生过早LH峰以后，卵子质量受损，妊娠率降低。
5、卵巢反应不良
即卵泡少，若发生，通过进一步处理后仍然反应不良，则本周期取消。
6、卵泡发育异常或出现不利于妊娠的内分泌学改变
7、取卵手术的并发症
取卵是一个手术过程，可能发生脏器损伤、出血、感染、血肿等并发症，严重时需开腹手术治疗。在少见的情况下，可能发生空卵泡综合症而取不到卵。由于卵巢位置异常，导致取卵困难及取卵率降低。为减少取卵手术的痛苦，我们常规使用静脉麻醉或止痛剂和局部麻醉药，在极其罕见的情况下，使用这些药物会出现麻醉意外，导致严重后果。取卵手术后，可能发生盆、腹腔脏器粘连等。
8、男性在取卵当天可能发生取精困难，经常规处理大多能成功取精
少数病例经常规处理无效而不得已进行细针睾丸或附睾穿刺取精，虽然细针睾丸或附睾穿刺取精术一般比较安全，但仍有可能发生出血、感染及影响睾丸功能等并发症。
9、男性的精液参数存在很大波动，少、弱精患者的精液参数则波动更加明显
若取卵当天丈夫精液参数异常，估计使用常规体外受精所得到的受精率低，可改用卵细胞浆内单精子显微注射以提高受精率。
10、卵子异常
有些不孕症是由于卵子异常所造成的，这种异常包括卵子的成熟障碍、结构异常等，但遗憾的是在取卵前，目前仍无法事先预知卵子是否有缺陷。由卵子异常造成的不孕症目前无有效的治疗方法。
11、受精异常
包括受精率低、不受精及异常受精等。若发生受精障碍或受精率低，可以作补救性卵细胞浆内单精子显微注射，但其正常受精率低、胚胎发育潜能差、移植后妊娠率低，由于在做补救性卵细胞浆内单精子显微注射时卵子已经老化，这种助孕技术的安全性尚不清楚。
12、胚胎发育异常
包括受精卵不卵裂、胚胎发育迟缓、胚胎碎片多、胚胎分裂异常等。目前，尚无法治疗。
13、胚胎移植困难
一般罕见，主要发生于宫颈管畸形、宫颈内口过紧等具有宫颈功能障碍患者。
14、妊娠问题
通过体外受精-胚胎移植获得的妊娠和自然妊娠一样，也有流产、早产、死胎、宫外孕、胎儿畸形等妊娠问题。
15、多胎妊娠发生率较高
体外受精－胚胎移植多胎妊娠率明显增加，容易发生妊高征、胎膜早破、贫血、产后出血、分娩困难、流产、早产、死胎、胎儿发育异常等妊娠问题。根据卫生部有关文件的规定，若发生2胎以上的多胎妊娠，需行减胎术。减胎术有感染、出血、流产、早产、胎膜早破、胎儿死亡等风险，且不能保证留下的胎儿没有畸形。减胎需住院进行，减胎的费用包括住院费、检查费、减胎手术费和药物费用等。
16、远期并发症
曾有研究者怀疑使用促排卵药物会增加卵巢癌的发生率，但目前仍无定论，有待进一步研究。
