1.血浆胰岛素生长因子1(IGF-l)降低：胰岛素生长因子1在调节物质代谢和促进生长发育中具有重要作用，营养不良患者在其身长(高)，体重等体格发育指标尚未改变之前已下降，且不受肝功能的影响，被认为是蛋白质营养不良早期诊断灵敏可靠的指标，黄永兰等近有报道，营养不良性生长迟缓儿童其血清IGF-l水平显著降低，降低的程度与体格发育指标异常程度相关。
2.氨基酸相关的比值：血浆必需氨基酸与非必需氨基酸相关的比值下降，可出现氨基酸尿，血浆牛磺酸含量明显降低，也可作为早期诊断指标。
3.血清酶活性降低：多种血清酶活性降低，如淀粉酶，胆碱酯酶，转氨酶，碱性磷酸酶，胰酶和黄嘌呤氧化酶等的活性降低，治疗后又很快恢复正常。
4.血糖水平降低：呈糖尿病型耐量曲线。
5.血清胆固醇：血清胆固醇水平降低。
6.微量元素含量降低：如血清铁，锌，硒，铜，镁等均低，尤以血锌在重度营养不良降低显著，近有报道血清锌降低与血清IGF-1降低呈显著正相关。
7.人体测量：测量身高，体重，上臂围，上臂肌围，头围，胸围，腹围;测定特定部位的皮褶厚度等，以判断儿童生长发育情况，明显低于同龄人。
8.肌酐/身高指数：肌酐是全身肌肉的分解产物，正常时每天的排出量比较恒定，蛋白质贮存下降时，肌肉萎缩，导致肌酐生成量减少，因此肌酐/身高指数减少，评价时可用24h尿中肌酐排出量除以身高相应的中等体型的理想肌酐排出量，求出实际排出量为理想排出量的百分数，诊断标准是：>90%正常;80%～90%为轻度营养缺乏;60%～80%为中度营养缺乏;<60%为严重营养缺乏。
9.放射学检查：常规并不需要，但如发现佝偻病，骨质软化症，婴儿性坏血病或蛋白质热能营养不良时，X线检查是必需的。
10.心电图检查：脚气病，钾缺乏，硒缺乏(克山病)都累及心脏，心电图检查有助于诊断及治疗。
11.暗适应检查：伴有维生素A缺乏时，适应时间延长。
