有关研究指出，70%的偏头痛发生在女性经期前后。近3/4的偏头痛患者是女性，所以有理由认为激素的波动是造成这一现象的重要原因之一。
一些专家指出，经期头痛与血清中的雌二醇(一种女性激素)浓度变化有关。在月经前后，血清中的雌二醇浓度降低，从而引起血管张力的变化，使一部分对此敏感的患者发生头痛。月经后，血清中雌二醇浓度回复至正常，病人的头痛亦可缓解或者消失。
但是，临床上常见的经期头痛，却和内分泌紊乱紧密相连。现实生活中，女性在工作时难免遇到一些不顺心的事或一些棘手的问题，加上现代都市紧张的生活和工作压力，使大脑神经处于紧张状态。精神疲乏、缺少运动、睡眠不足，甚至还有些女性，因为减肥长时间不吃东西。这些不好的生活习惯，都可能会导致内分泌紊乱，进而引发经前综合征。
从中医角度，可以把经期头痛称为经行头痛。是由长期生活习惯不良或者情绪不稳定引起的，它会导致体内毒素长期淤积，毒素进入血管，引起血管扩张，从而造成头痛。
