1、遗传因素。如果胎儿的染色体的数目或结构异常，就会导致胚胎发育不良。在自然流产的情况中，特别是怀孕的头三个月发生的流产，遗传因素占了60%-70%，其中流产儿的染色体异常占50%-60%，夫妻一方或双方有染色体异常的占有10%。
2、母体的疾病。孕妇患有不利于胎儿生长发育的疾病都会造成胎儿流产。
3、外界不良因素。如：孕妇大量吸烟或被动吸烟、喝酒、接触化学物质或毒物，生活在严重的噪声、高温和震动的环境中，情绪异常激动等，这些因素都会导致胎盘和胎儿损伤，造成流产。
4、男性的因素。大约有10%-15%的男性的精液中含有一定数量的细菌，是无症状的菌精症，会引发流产。
女性在自然流产后对妊娠会失去一定信心，如自然流产超过半年仍然没有怀孕，女性对于妊娠信心会很快减退。有研究表明，自然流产后三个月内再次妊娠者流产率与三个月后妊娠者的流产率相当，大概都是游离在16%~20%之间，同时，妊娠时间间隔一年以上期流产率明显高于一年内妊娠者。要因此，若夫妻都希望尽早有小孩，而自然流产后女性身心恢复都完就可以尽早要孩子。
