藥物因療效以外的作用而影響身體時，我們稱之為副作用，也稱為藥物毒性作用或不良事件。首先，你必須瞭解，許多副作用的症狀與艾滋病本身的某些症狀是非常相似的。
雖然大多數藥物都有某些副作用，但是大部分的副作用都比較輕微而且容易解決。而且，大多數臨床醫生認為，多數副作用會隨著用藥時間的延長而減輕。有時，它們隻影響某一類病人;有時，經過許多人服用了比當初試驗更長的時間後，某些副作用才會明顯地產生而被人們認識。
所有的藥物都有副作用，但不是所有吃同樣藥物的人會產生同樣的或是同等程度的副作用。藥品說明書中一般會列出藥物可能發生的副作用，你可以用它作為參考。
如果你是第一次服用艾滋病抗病毒藥物，你可能擔心會有副作用。但如果在用藥之前你能預先知道每種藥物可能產生的後果，會很有幫助。你可以向你的醫生詢問可能發生的副作用。
目前國際上共有18種被批准的艾滋病抗病毒藥物,即使不是所有的藥物都可以組合搭配，在使用上，你還是有很多選擇,目前國內上的藥物有7-8種組合，如果感覺你正在使用的藥物組合中，有一種或幾種藥物讓你很難忍受，你可以更換其他藥物。
