超聲波有死角，檢測結果會受限制，且判讀結果會受到很多因素影響，如媽媽肚皮的厚度(母體脂肪太厚，超聲波穿透力減弱，會導致影像看不清楚)、胎兒的位置、角度、姿勢、動態、羊水的多寡等。有些異常超聲波根本看不到，如代謝性疾病。不能要求一次超聲波就檢查出所有的異常，特別是細微的構造，包括手指有幾根、幾節、耳朵有沒有耳垂、鼻子挺不挺等。
目前許多醫院都會在妊娠10～12周時發給準媽媽健康手冊。大約在20周左右，會進行產檢超聲波，看看胎兒器官發育的狀況，但如果照的那一次，胎兒沒有轉到正面或在對的位置，都無法正確判讀胎兒的狀況。如果準媽媽不放心，可要求再高層次照超聲波。高層次超聲波彩超的黃金診斷期在20～24周，之後胎兒會長大，器官也會愈來愈大，骨骼會愈來愈鈣化，超聲波能透視看到的狀況也會隨之降低。
