發達國家的小兒肺炎以病毒病原為主，發展中國家小兒肺炎以細菌病原為主。一般支氣管肺炎由細菌所致者，流感嗜血桿菌和肺炎鏈球菌佔細菌性肺炎的60%以上。
葡萄球菌也是一種重要致病菌。鏈球菌、大腸桿菌、肺炎桿菌、綠膿桿菌在嬰幼兒肺炎中較少見。細菌毒力與細菌的結構有關，有莢膜細菌可以抵禦噬菌作用，毒力較大。同一種細菌按莢膜成分不同的而分類若干血清型。不同型細菌的莢膜不同，毒力也不同。流感嗜血桿菌分為a-f六個血清型。其中b型毒力最大，是小兒敗血症、腦膜炎和肺炎的主要致病菌之一，莢膜多糖為核糖磷酸。流感嗜血桿菌引起的小兒肺炎常繼發於支氣管炎、毛細支氣管炎或敗血症，3歲以前較為多見。無莢膜的流感嗜血桿菌為不定型，毒力小，一般只引起上呼吸道感染。β溶血性鏈球菌可以在麻疹或百日咳病程中作為繼發感染出現，但不多見，而其中B族溶血性鏈球菌是國外新生兒肺炎的常見病原菌，國內尚未引起足夠重視。凝固酶陽性的金黃色葡萄球菌也是小兒重症肺炎的常見病原菌。凝固酶陰性葡萄球菌(主要指表皮葡萄球菌)近幾年來國內分離較多，但因其為條件致病菌，培養過程中易汙染，須結合臨床判斷是否確為肺炎的病原菌。大腸桿菌所引起的肺炎主要見於新生兒及營養不良的嬰兒，也可繼發於其它重病的過程中，肺為桿菌肺炎及綠膿桿菌肺炎較少見，一般均為繼發性。
間質性支氣管肺炎大多數由於病毒所致，主要為腺病毒、流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒和麻疹病毒等。間質性支氣管肌炎也可由於流感嗜血桿菌、百日咳桿菌、鏈球菌中某些型別及肺炎支原體所引起。
支氣管肺炎的病理形態為一般性和間質性兩大類。
1、一般支氣管肺炎 主要病變散佈在支氣管壁附近的肺泡，支氣管壁僅粘膜發炎。肺泡毛細血管擴張充血，肺泡內水腫及炎性滲出，漿液性纖維素性滲出液內含大量中性粒細胞、紅細胞及病菌。病變通過肺泡間通道和細支氣管向周圍鄰近肺組織蔓延，呈小點片狀的灶性炎症，而間質病變多不顯著。有時小病灶融合起來成為較在範圍的支氣管肺炎，但其病理變化不如大葉肺炎那樣均勻緻密。後期在肺泡內巨噬細胞增多，大量吞噬細菌和細胞碎屑，可致肺泡內纖維素性滲出物溶解吸收、炎症消散、肺泡重新充氣。
2、間質性肺炎 主要病變表現為支氣管壁、細支氣管壁及肺泡壁的發炎、水腫與炎性細胞浸潤，呈細支氣管炎、細支氣管周圍炎及肺間質炎的改變。蔓延範圍較廣，當細支氣管壁上細胞壞死，管腔可被粘液、纖維素及破碎細胞堵塞，發生侷限性肺氣腫或肺不張。病毒性肺炎主要為間質性肺炎。但有時灶性炎症侵犯到肺泡，致肺泡內有透明膜形成。晚期少數病例發生慢性間質纖維化，可見於腺病毒肺炎。
