1、遺傳因素：
抽動穢語綜合症患兒家族中患抽動症和抽動穢語綜合症的發病率為10%-66%。
2、藥源性因素：
長期使用中樞神經興奮劑，如多動症患兒長期服用苯丙安、利他林，可產生抽動障礙或使抽動症加重，這也是抽動症的病因。
3、器質性因素：
研究提示抽動-穢語綜合徵屬於器質性疾病。約50%-60%的抽動-穢語綜合徵患兒有腦電圖非特異性異常。
4、神經生化因素：
由於中樞神經遞質功能失調所致。
5、其他因素：
結膜炎因眼乾難受所以眨眼，咽炎因咽痛咽癢所以乾咳，長時間的眨眼乾咳，當結膜炎、咽炎愈後可致習慣性抽動、眨眼、乾咳。近年發現抽動-穢語綜合徵與β-溶血性鏈球菌感染有關。臨床也發現感染髮熱可使抽動-穢語綜合徵和強迫症加重。
