1、遺傳因素
大量調查表明，多發性抽動症具有明顯的遺傳傾向，其遺傳方式傾向於常染色體顯性遺傳，伴不完全外顯率，而且外顯率存在著性別差異，男孩患病率高於女孩。
2、中樞神經遞質失衡
目前較公認的觀點是認為本病存在神經突觸多巴胺活動過度，與多巴胺受體超敏反應有關。己證明DA—D受體拮抗劑氟哌啶醇能阻斷紋狀體內DA受體，能有效控制抽動症患兒的抽動，已廣泛應用於臨床。
其他神經遞質有5-羥色胺及去甲腎上腺素參與抽動症的發病，γ-氨基丁酸，興奮性氨基酸如穀氨酸、天冬氨酸，膽鹼類遞質等也與抽動症發病相關。
3、神經生化改變
有研究提示，阿片肽、催乳素、性激素、環磷酰胺、嘌呤代謝、鈉鉀ATP酶、微量元素如鈣、鋅、鉛等的體內水平與多發性抽動症存在關聯。
4、腦結構或功能異常
皮層-紋狀體-丘腦-皮層(CSTC)環路結構和功能異常與抽動障礙的發生有關。研究發現兒童和成人抽動障礙患者基底節部位尾狀核體積明顯減小，左側海馬局部性灰質體積增加。對發聲抽動的功能磁共振成像研究發現，抽動障礙患者基底節和下丘腦區域激活異常，推測發聲抽動的發生與皮層下神經迴路活動調節異常有關。
5、精神、環境因素
家庭、教育和社會環境對抽動症的誘發或加重也有重要意義。爸媽對孩子管教過嚴、孩子學習負擔過重、長期焦慮不安、受驚嚇、不良家庭環境、家庭生活不愉快等因素，都可能誘發抽動症。長時間看動畫片或迷戀於電腦遊戲也可誘發抽動或使症狀加重。
6、免疫因素
有研究報道大約20%-35%的抽動症發病與感染後自身免疫病理損害有關，即“兒科自身免疫性神經精神疾病併發鏈球菌感染”。也有研究報道認為抽動症與病毒及支原體感染有關。
7、圍產期因素
孕媽媽在懷孕期間如果精神緊張、受到驚嚇，或是過度悲傷，生產過程中出現的各種狀況導致患兒腦損傷、腦缺氧等原因都可以導致抽動症的發生，圍產期的各種損害也是抽動症的危險因素。
8、創傷因素
有報道抽動症與頸椎損傷有直接關係，當頸椎關節、韌帶損傷後涉及周圍血管、神經組織，出現頸部不適等一系列症狀，而關節的長期的錯位可引起脊柱的功能異常及力學改變，從而出現聳肩、搖頭等臨床症狀。
9、其他因素
如過敏因素、食物因素、藥物因素及誘發因素等。
