一般來說對男性影響不大，但也有導致一些疾病的記錄，我曾在廣播裡聽到過。而對女性來說，影響是極大的。陰道的解剖生理特點和陰道內的酸性環境，對女性生殖器官來說是一道天然的防禦屏障，使之免遭細菌的侵襲。但在月經期，子宮內膜剝脫，鹼性的經血中和了陰道的酸性環境，使天然屏障功能被削弱。
如果不注意經期衛生，甚至在月經期性交，將會把細菌帶入生殖道內，極易引起感染。而且經血是細菌等微生物的良好培養基，子宮內膜存在著許多微小傷口和小血管破裂，細菌極易滋生，感染極易擴散。而且最容易導致女性不孕。經期性交，細菌可輕易地進入子宮腔引起炎症，甚至可累及輸卵管和盆腔器官。由於炎症刺激，受精卵難以著床，而輸卵管的粘連、堵塞更是造成不孕的直接因素。
經期性交還可因子宮的收縮使經血進入腹腔.有引起子宮內膜異位症的危險。經期性交，部分精子及精液的其他成分有可能經小血管裂口進入女性的血液循環，刺激免疫系統而形成抗精子抗體。可見，經期性交是導致女性不孕的重要原因。
