從B超原理上分析，B超是超聲傳導，不存在電離輻射和電磁輻射，是一種聲波傳導，這種聲波對人體組織沒有甚麼傷害;但如果聲波密集在某一固定地方，又聚集很長的時間的話，就會有熱效應，這種熱效應達到一定程度時，可能會對人體組織產生不良的影響，影響細胞內的物質，包括染色體。
理論上是高強度的超聲波可通過它的高溫及對組織的腔化作用，對組織產生傷害，但事實上，醫學使用的B超是低強度的，低於94毫瓦/立方厘米，對胎兒是沒有危害的，至今尚沒有B超檢查引起胎兒畸形的報道;目前，各醫院在產科領域中使用的B超檢查對胎兒是安全的。
但是，這並不意味著在整個妊娠期可以隨意地做B超檢查，而沒有時間和次數的限制。曾經有學者做過這樣的實驗，對十一到十二週的胎兒眼睛的晶狀體和角膜進行 B超照射，發現沒有照射過的，沒有任何影響，照射五分鐘的，角膜或晶狀體有輕度水腫，照射十分鐘的，水腫程度較照射五分鐘的重一些，但是可逆的，停止照射後可恢復正常。如果照射時間超過了二十分鐘，改變就不可逆了，所以，有學者建議，一次B超的時間不要超過五分鐘。
溫馨提示：
世界衛生組織提出，在必要時才運用超聲，如無充分的理由，胎兒不應該受到照射;美國超聲機構提出，不把B超作為早孕診斷手段。
