卵巢囊腫在早期沒有明顯的臨床表現，往往在患者因其他疾病就診時的婦科檢查中被發現。後來隨著腫瘤的生長，患者會有感覺，其症狀和體徵因腫瘤的性質、大小、發展以及是否有繼發性變性或併發症而不同。
下腹不適：
這是患者觸及下腹腫塊之前的最初症狀。腫瘤本身有重量，受腸蠕動和體位變化的影響，使腫瘤在骨盆內移動牽拉其頂端和骨盆漏斗韌帶，使病人有下腹或骼窩飽脹和下沉的感覺。
腹部增厚和腹內腫脹：是最常見的投訴。患者在注意到腹部增大之前，發現自己的衣服或腰帶顯得很緊，或者在早晨偶然感覺到，從而通過自己按壓腹部發現腹部腫脹，同時還有腹脹的不適感。
腹痛：
如果腫瘤不復雜，很少有疼痛感。因此，卵巢腫瘤患者會感到腹痛，尤其是突然發生的腹痛，最常見的是由於腫瘤頂端的扭轉，或偶爾由於腫瘤破裂、出血或感染。此外，惡性囊腫往往會引起腹痛和腿痛，這種疼痛常常使患者緊急就醫。
月經紊亂：
通常卵巢，甚至雙側卵巢囊腫，不會引起月經紊亂，因為它們沒有破壞所有正常的卵巢組織。在某些情況下，子宮出血不是內分泌性的，或由於卵巢腫瘤改變了盆腔內的血管分佈，造成子宮內膜充血；或由於卵巢惡性腫瘤直接轉移到子宮內膜。因內分泌腫瘤而發生的月經紊亂常與其他分泌性影響因素合併。
壓迫症狀：
巨大的卵巢腫瘤可能因壓迫橫膈膜而引起呼吸困難和心悸，卵巢腫瘤有大量腹水時也是如此；但有些卵巢腫瘤患者因一側或兩側胸腔積液而出現呼吸困難；且常與腹水合並，形成所謂M eigs綜合徵。
