1.染色體異常 主要根據胚胎染色體和夫婦雙方外周血染色體核型分析，以明確是胚胎的染色體異常，還是父源性或母源性的染色體異常。
2.內分泌功能檢查 臨床上主要根據患者月經週期情況、基礎體溫、全套性激素測定、子宮內膜活檢以及甲狀腺功能和血糖檢測等，以瞭解是否存在黃體功能不全或其他內分泌疾病。黃體功能不全的實驗室診斷依據為：子宮內膜活檢顯示子宮內膜發育落後於月經週期天數2天或以上。
(1)孕激素：黃體期測定24小時尿孕二醇，正常值為6～22μmol/24h尿，小於下限者為黃體功能不全
(2)HCG：一般妊娠後8～9天在母血中即可測出HCG，隨著妊娠的進程，HCG逐漸升高，早孕期HCG倍增時間為48小時左右，孕8～10周達高峰。血清β-HCG值低或呈下降趨勢，提示可能發生流產。表2為妊娠時間現血清β-HCG及超聲的關係。
(3)人胎盤催乳素(HPL)：HPL分泌與胎盤功能密切相關。妊娠6～7周時血清HPL正常值為0.02mg/L，8～9周為0.04mg/L。HPL低水平常常是流產的先兆。
(4)宮頸黏液：如塗片中見到羊齒狀結晶，提示預後不良。
(5)陰道細胞學檢查：陰道塗片中見有絨毛合體細胞，流產的發生率幾乎達到100%;因此，此法可以預測流產的轉歸，一旦出現此種細胞宜及早終止妊娠。合體細胞在塗片上的特點是：細胞大小不等，胞質嗜鹼性，含有不同數目的深染色細胞核，常被紅細胞和白細胞包圍。
(6)甲狀腺素和血糖測定：甲狀腺功能低下和亢進均易發生流產。核素測定遊離T3和T4有助於孕期甲狀腺功能的判斷。正常空腹血糖值為5.9mmol/L，異常時應進一步做糖耐量試驗，排除糖尿病。
3.感染有關檢查 應包括弓形蟲(TOXO)、鉅細胞病毒(CMV)、沙眼衣原體(CT)、人支原體和解脲支原體(MH，UU)等的檢查。
4.免疫檢查(1)自身免疫型複發性流產：患者排除胚胎及夫婦外周血染色體核型、生殖道感染、內分泌及生殖器官解剖等異常情況。自身抗體檢測陽性。常有2種情況：①抗磷脂抗體(ACL,LCA)陽性;②抗核抗體(ANA)和可抽提核抗原抗體(ENA)陽性。
(2)同種免疫型(不明原因性)習慣性流產：
①經染色體、解剖、內分泌和感染等方面病因篩查未見有任何異常。
②各種自身抗體陰性。
③封閉抗體缺乏，微量淋巴細胞毒試驗(LCT)陰性，單向混合淋巴細胞培養(MLC)+抑制試驗表明為增殖抑制明顯降低。
