鹼性磷酸酶高的原因的原因分為兩大類，一種是因為正常的生理性而增高，一種是病理性增高，也就是因為疾病影響而增高。詳細原因如下：
1、生理性增高
兒童在生理性的骨骼發育期，鹼性磷酸酶活力可比正常人高1～2倍。處於生長期的青少年，以及孕婦和進食脂肪含量高的食物後均可以升高。
2、病理性升高
(1)、阻塞性黃疸、肝硬化、肝壞死，鹼性磷酸酶明顯升高(肝細胞性黃疸則升高不明顯)。
(2)、原發性和繼發性肝癌時鹼性磷酸酶亦明顯升高，與癌組織中或癌腫周圍肝細胞合成鹼性磷酸酶增加有關。
(3)、其他腫瘤如乳腺癌、肺癌、卵巢癌、骨細胞瘤、骨肉瘤等，鹼性磷酸酶增高時，提示可能有肝臟轉移。
(4)、變形性骨炎、成骨細胞癌、佝僂病、骨軟化、甲狀腺及甲狀旁腺功能亢進、腎小管性酸中毒、遺傳性磷酸酶過多症
(5)、很多藥物可使鹼性磷酸酶增高，如巴比妥類、抗生素(卡那黴素、慶大黴素、氯黴素、氨苄青黴素、紅黴素等)。
