1、中樞神經-下丘腦異常
包括精神應激性，如環境改變、過度緊張、精神打擊等精神應激引起的反應;還有體重下降、神經性厭食、過度運動、藥物等引起下丘腦分泌促性腺激素的調節功能失調或抑制;另外還有先天性疾病或腦發育畸形及腫瘤引起激素分泌異常。
2、垂體性異常
指腦垂體病變使促性腺激素分泌異常，有先天性因素也有後天形成病變，如垂體腫瘤等。
3、卵巢性異常
由於卵巢先天性發育不良或卵巢功能異常或繼發病變引起月經異常，如多囊卵巢綜合徵，臨床表現為月經稀發、不規則、多毛、肥胖等;卵巢功能性囊腫;卵巢腫瘤等因激素改變而影響月經。再就是嚴重的盆腔感染，也可使雙側卵巢組織受到破壞，從而影響月經，甚至可發生永久性閉經，其中以結核病變多見。
4、子宮性異常
子宮發育不良，子宮內膜破壞也可引起月經稀發，甚至閉經。子宮內膜破壞包括炎性因素，如子宮內膜結核;還可發生於產後或人工流產後過度刮宮引起的子宮內膜基底層損傷或粘連等。
