卵巢一般可在22天內恢復排卵功能，1個月左右月經來潮。但有少數婦女在人工流產後出現經期延長、週期長短不一、閉經等月經失調現象。這種情況一般在2-3個月後恢復正常，少數人持續時間較長。
婦女發生月經是由大腦皮層、下丘腦、腦垂體、卵巢和子宮相互作用的結果，受神經內分泌調節。當人處於過分緊張、恐懼、憂傷、過度勞累和手術等情況時，都能通過神經內分泌系統來抑制下丘腦、腦垂體、卵巢、子宮的功能，從而導致月經異常。人流後胎盤絨毛膜促性腺激素驟然消失，使卵巢一時不能對垂體前葉分泌的促性腺激素髮生反應，因而也會出現月經不調。
在人流過程中，過多地損傷了子宮內膜基底層，則子宮內膜不能再生，這樣使病人發生長期閉經。一般人工流產生月經不調可自行調節一段時間，不會有甚麼傷害，但如果時間過長，則必須就醫查明原因。
