硃砂的主要成份為硫化汞，還常夾雜雄黃、磷灰石、瀝青質等。其中含有的砷、鉛、銻等都對人體有害。硃砂有無鎮靜催眠作用，認識不甚一致，有解毒防腐作用，外用能抑制或殺滅皮膚細菌和寄生蟲。
其主要成分硫化汞可導致汞中毒。研究表明一天從藥物中口服硫化汞超過262毫克即可導致慢性中毒，而一些中成藥藥丸中含汞量相當高，如美國漁業及野生動物局法醫實驗室曾抽查的南京同仁堂產安宮牛黃丸中含汞量為80.7至621.3毫克，部分遠高於慢性中毒量。
臨床報告表明使用硃砂可能會出現肝腎臟損害、胃腸道反應、神經系統中毒、溶血性貧血、過敏反應等。
美國等國都已禁止藥物中使用硃砂。
正因為如此，為治病不得已用硃砂無異於飲鴆止渴，在中藥方劑中找到替代品是當前一個課題，在口服類中考慮以藏羚羊角、犀牛角、黃羊角、半枝蓮、鬱金、砂仁中加冰片、薄荷調整配方替代硃砂。
【功能主治】
安神，定驚，明日，解毒。治癲狂，驚悸，心煩，失眠：眩暈，目昏，腫毒，瘡瘍，疥癬。
①《本經》："養精神，安魂魄，益氣，明目。"
②《別錄》："通血脈，止煩滿、消渴，益精神，悅澤人面，除中惡腹痛，毒氣疥瘻諸瘡。"
③《藥性論》："鎮心，主抽風。"
④《日華子本草》："潤心肺，治瘡疥痂息肉，服並塗用。"
⑤《珍珠囊》："心熱非此不能除。"
⑥李杲："納浮溜之火而安神明。"
⑦《醫學入門》："痘瘡將出，服之解毒，令出少。治心熱煩跺。潤肺止渴，清肝明目，兼辟邪惡瘟疫，破癥瘕，下死胎。"
⑧《綱目》："治驚癇，解胎毒、痘毒，驅邪瘧，能發汗。"
⑨《本草從新》："定顛狂，止牙疼。"
【用法與用量】
內服：研末，1～3分;入丸、散或拌染他藥同煎。並作丸藥之掛衣。外用：合他藥研末幹撒。
【宜忌】
不宜久服、多服。
