1 、菟絲子種子類圓形或卵圓形,腹枝線明顯,兩側常凹陷,長徑1.4-1.6mm,短徑0.9-1.1mm。表面灰棕色或黃棕色,微粗糙,種喙不明顯;於擴大鏡下可見表面有細密深色小點,並有分佈不均勻的白色絲狀條紋;種臍近圓形,位於種子頂端。種皮堅硬,不易破碎,用沸水浸泡,表面有粘性,煮沸至種皮破裂,露出黃白色細長卷旋狀的胚,稱“吐絲”。除去種皮可見中央為捲旋3周的胚,胚乳膜質套狀,位子胚周圍。氣微,味微苦、澀。
2、南方繭絲子與上種相似,但種子卵圓形,腹稜線不明顯,大小相差較大,長徑0.7-2.0.Mm,短徑0.5-1.2mm。表面淡褐色至棕色,一端有喙狀突出並偏向一側。於擴大鏡下可見種臍微凹陷,位於種子先端靠下側。
3、大菟絲子種子較大,長徑約3mm,短徑2-3mm,表面淡褐色或黃棕色。均以粒飽滿者為佳。