作為輔助藥，用於利尿消炎，去溼止痛、健脾止瀉。
1、用於治療輕症水腫，尤為腳氣水腫較適宜。慢性腎炎而水腫較輕者，可用薏苡仁和魚腥草等利尿退腫，並可根據患者脾腎陽虛的情況酌加杜仲、菟絲子、黃芪等補益藥，方如薏苡仁杜仲湯。
2、用於治療內癰。例如治肺癰的葦莖湯，治腸癰的腸癰方，均用本品配合。
3、用於治療溼熱痺痛(錄入風溼性肌炎、多發性神經炎)，可緩解肌肉攣縮疼痛，無論熱症寒症都可用，偏熱的，配絡石藤、稀籤草;偏寒的，配麻黃，方如麻杏薏苡甘草湯;溼重的，再加配蒼朮，方如薏苡仁湯。
4、用於健脾止瀉。薏苡仁的效力雖不及淮山藥，但仍能進食慾，幫助消化，治腳氣病和脾虛洩瀉。在健脾方劑內也常採用，如參苓白朮散。
此外，本品又可治皮膚扁平疣。可用50g，水煎服，或以100g煮粥，服用一個月作用，有一定效果。其治療原理尚待研究。
