音樂療法，可以幫助自閉症患者調整身體狀況，大大改進孤僻的生活狀態。這種療法能把孤僻的症狀縮小到很小的程度，它的原理在於通過刺激聽覺系統，達到刺激大腦的目的。那麼，如何運用音樂進行治療呢?
1、演唱“問候歌”
音樂治療師開始時與兒童建立關係的方法可以握著兒童的手唱著輕柔的《你好歌》，此時自閉症兒童很少拒絕。尤其在歌曲中加進被治療兒童的名字，兒童對治療師的“戒心” 更可能逐步消退。治療師在《你好歌》中可以培養兒童目光對視治療師的機會。自閉症兒童與治療師目光對視行為的增加是願意與外界建立關係的重要特徵之一。
當音樂治療結束時，一般情況自閉症兒童的情緒都會比治療開始時有所改善，因此自閉症兒童可以接受唱《再見歌》的方式結束治療。在音樂治療初期，許多牴觸情緒比較重的自閉症兒童在結束治療唱《再見歌》時，才開始產生交流願望。治療結束時治療師可以再次提示兒童目光對視，兒童在唱《再見歌》時與治療師目光對視的可能性比治療開始唱《你好歌》時增加了。
2、演奏小敲打樂器
經過《你好歌》後，治療師可以引導自閉症兒童選擇自己喜愛的小敲打樂器為音樂或歌曲伴奏，此時輔助音樂治療師也同兒童一起演奏小敲打樂器，使兒童在模仿音樂治療師的過程中能正確地把握演奏小敲打樂器的要領。這種訓練一般都是兒童隨治療師演奏或播放的音樂打節奏。
3、演奏兒童爵士鼓
還有一些自閉症兒童喜歡強烈的爵士鼓演奏，尤其有攻擊行為的兒童喜歡在音樂治療中用比較長的時間打爵士鼓。打爵士鼓對轉移、削減其攻擊行為具有一定的治療作用，治療師為這類兒童配置的音樂常需要跟隨兒童打的節奏即興創作音樂，然後逐步過渡到讓兒童隨治療師的音樂節奏打鼓。雖然兒童不可能掌握太多爵士鼓演奏技巧，但多個鼓的敲打和加上腳踩鼓的爵士鼓特色，明顯在訓練兒童協調能力等方面優於普通大鼓的單一打法。
4、演奏木琴、甩琴等
自閉症兒童對小敲打樂器、甩琴、木琴等一般興趣都不會太長，雖然有時可能繼續按音樂治療師要求去操作樂器，但從其遊離的目光就可以發現兒童已處於被動狀態，這時治療師需要換下一種訓練項目，儘快結束兒童注意力不集中狀態。
5、音樂律動訓練
針對牴觸情緒較重的自閉症兒童可以靠演奏或播放音樂來打動兒童，治療師根據兒童的現場表現找到適合他的音樂，允許兒童在感受音樂時自由活動，其間治療師及時抓住兒童表現出的律動節奏，為兒童即興創作或播放適合他的音樂。
6、聽賞樂曲
單純播放音樂或即興彈奏、哼唱無詞歌的形式適合重度自閉症兒童和語言表述能力較差、注意力集中時間太短以及年齡偏小的自閉症兒童。適合自閉症兒童的聽賞音樂風格大部分為比較歡快的節奏，不侷限兒童音樂的選曲範圍和地域。在自由活動中感受一段音樂後，兒童有可能接受過去從來不接受的與治療師簡短對話和治療師指令。
總之，自閉症兒童在感受一段歡快音樂後，原有對外界的牴觸情緒有可能發生變化。大量的中外自閉症兒童音樂治療案例顯示聽賞音樂可以引發自閉症兒童與他人建立關係的慾望。
7、帶表演的歌唱
帶表演的歌唱活動在許多自閉症兒童中不是太受歡迎，一方面由於歌詞的語言表達對於部分自閉症兒童有一定困難，可能產生壓力後影響演唱興趣，另一方面許多自閉症兒童對與音樂治療師一同進行歌表演有被“束縛”的感覺，似乎歌詞限制了兒童的某種“寬鬆感”。但許多表演唱歌詞中的認知內容對兒童的成長是有益的，自閉症兒童也可接受一些歌表演活動，時間不宜過長。
8、拍手唱
兒童常常沉浸身體自我刺激的突出表現就是玩弄手，所以我們可以藉助這個動作進行一對一的互動，跟著節拍唱歌，儘管孩子不說，但她也會隱隱的知道了音樂的節拍概念，當你與孩子擊掌時她，儘管一開始並不對視，但隨著你唱歌聲音增大，以及稍稍變化節奏時，孩子會發現變化，從而開始注意到你的存在。當你加速和減速的時候，孩子會有情緒反應，甚至有時會出現少數的主動語言。慢慢將互相擊掌演化出一些其他的隨音樂律動的動作，可以形成舞蹈。
