影響容貌美觀和發育：常見的有開唇露齒、牙齒前突(即暴牙)、雙頜前突、雙重牙等。是典型的難看牙，容易令青少年產生自卑感;另外，如果牙牙齒咬合錯位而沒有及時矯正，那麼，人的頜面部骨骼就會適應性生長，最終導致面部發育的不協調，表現為難看的“歪臉”、“鳥嘴”樣貌或“大下巴”。
影響口腔功能：嚴重的牙齒咬合錯位，令咀嚼效率嚴重降低，引起消化不良及胃腸疾病，不利於兒童的生長髮育。另外，前牙開頜，容易造成發音的異常，後牙鎖頜，還可影響咀嚼功能，嚴重的下頜後縮則影響正常呼吸等等。
累及牙體及牙周健康：牙齒咬合錯位的牙齒之間容易堆積食物殘渣，不容易刷乾淨，最終導致牙結石沉積、牙齦紅腫、牙齦萎縮和牙槽嵴吸收，嚴重者會出現牙齒鬆動等;此外，個別牙齒還容易出現咬合創傷，表現為個別牙齒疼痛、牙齒出現裂紋或頸部缺損、牙齒咬合痛等。
牙齒咬合錯位有哪些危害?醫生呼籲，牙齒咬合錯位現象，反應的不僅僅是牙齒功能問題，更多是對頜面美觀的影響。因此，關注青少年身體健康和未來的形象、前途，督促青少年暑期正畸，是每個父母重大責任和義務，不可輕視。
