妊娠期用藥
無阿糖胞苷用於懷孕婦女的研究。已知本品對一些動物種屬有致畸作用。對已經或可能懷孕婦女使用本品前需考慮對孕婦和胎兒潛在的利弊。建議育齡期婦女避孕。
懷孕期間接受過阿糖胞苷(單獨或與其他藥物聯合應用)治療的孕婦，可以分娩正常的嬰兒，但也有可能是早產兒或低體重兒。一些接觸過阿糖胞苷的正常嬰兒從出生後六週開始隨訪一直到七歲，並未發現異常。有一名似乎正常的嬰兒在出生90天時死於胃腸炎。
有先天性畸形的報道，特別是當胎兒在妊娠前3個月內接觸了全身應用的阿糖胞苷時。此類畸形包括上肢和下肢遠端缺損以及手足和耳的畸形。
宮內接觸阿糖胞苷的嬰兒，在新生兒期有發生全血細胞減少，白細胞減少、貧血、血小板減少、電解質異常、短暫的嗜酸眭粒細胞增多、IgM水平增高和高熱、膿毒血癥及死亡的報道。這些嬰兒中也有部分是早產兒。
對接受阿糖胞苷治療的孕婦曾施行過治療性流產。儘管有胎兒正常的報道，但其他報告均顯示對胎兒有影響，這種影響包括脾腫大和絨毛膜組織中C組染色體三體異常。
因為細胞毒藥物潛在的致畸作用，特剮在妊娠早期(最初的三個月)，應將對胎兒潛在的危險性和是否適宜繼續懷孕告知已經或可能懷孕的應用本品的患者。如果治療開始於懷孕中後期，仍存在致畸危險，但相對較小。雖然有在懷孕全程均接受治療的患者仍分娩正常嬰兒，但應建議對這些嬰兒進行隨訪。
哺乳期用藥
目前尚不知道藥物是否從人乳汁中分泌。由於許多藥物可從人乳汁中分泌，而且阿糖胞苷對哺乳嬰兒具有潛在的嚴重不良反應，必須根據藥物對母親的重要性來決定是否停止哺乳或停用藥物。
