一、對神經方面的傷害
接種天花疫苗會造成神經方面的傷害在醫學界已經是眾所皆知，如今又發現百日咳疫苗(whooping cough)也會造成神經方面的傷害，可能造成的後遺症包括了腦炎、痙攣、髓膜炎，較輕的症狀則會讓人的學習能力減低或是使人輕微的行動不便。在美國提出的報告已建議接種者的本人或家庭中有痙攣病症者不要接種百日咳疫苗;在德國及瑞典更是認為接種百日咳疫苗的後遺症比得到百日咳更為嚴重而全面停止此疫苗之接種。在美國因為接種此疫苗而受害的人數之多，要求的賠償金額已達到最大的疫苗製造商面臨倒閉的危機，而在此所指的受害者僅是指人體已經受害達到百分之八十的殘廢者，尚未包括那些較輕的受害者。一篇法國的醫學報告指出，曾經有過神經方面傷害的兒童、本人或家庭有癲癇病例者，或是得了嚴重的慢性病的兒童若接種百日咳疫苗會有很大的危險性。除了身體的後遺症之外，在接種天花疫苗後的數週到數月之內，常會有情緒上的問題產生，這種情緒上的問題會持續一年到十一年之久。接種疫苗使得兒童無法專心，進而導致焦慮不安。尤其是我們的社會提倡每人都得接種，在每人都受接種的情況下，使得這種情緒上的問題不再只是個人的問題，而是影響到整個年齡群。這些群體的情緒現象包括無生氣、被動、對大部分的事情提不起興趣、畏縮等。
二、接種疫苗可能引發及傳染艾滋病
根據英國《泰晤士報》(Times)在一九八七年五月十一日登載指出，非洲國家之所以會開始有艾滋病，都是因為在一九七○年到一九八○年間，世界健康組織所倡導的天花疫苗接種活動所種下的因;巴西是中、南美洲艾滋病最嚴重的國家，也是中、南美洲唯一全面倡導接種疫苗的國家。艾滋病是在一九七八年才發現的新疾病，主要的傳染媒介是經由血液、精液，而目前有一些疫苗的製造是經由血漿或是人的胚胎來培養的。在一九八一年，發生了一批被病菌感染的血液被用來製造疫苗而且被大量使用的醜聞，在當時並沒有檢驗艾滋病毒的程序，令人不禁懷疑，如果這批疫苗感染了艾滋病毒，則它們對整個世界造成了甚麼樣的影響?美國有兩位研究艾滋病的專家提出，他們懷疑所有使用非洲猴子細胞培養的藥或疫苗均是散播艾滋病病毒的原因之一。書上並指出接種疫苗後幾天(尤其是第三到第四天)會導致人體的免疫功能降低，這一段時期的現象和得了艾滋病很相似，所以有醫生指出，小孩子的免疫功能正在發展時期，而在此時接種疫苗讓他們經歷這種「艾滋病類似期」將會造成何種的影響?有個病歷是一位美國士兵在連續接種數次疫苗(其一為天花疫苗)後得了天花，進而演變成艾滋病而導致死亡。據報告是因為天花疫苗引發了他體內潛伏的HIV病源，而連續的接種則加速了艾滋病的發病。
三、接種疫苗是癌症及血友病的溫床
早在四十年前即有一位醫師提出「接種疫苗會激發血友病」，這已是醫學界眾所皆知的，如今更有醫生深信連續的接種是造成癌症的溫床，因為接種天花疫苗而不久之後得了血友病的病例也是層出不窮。根據醫學界的研究及實際的病例都一再地顯示疫苗接種，尤其是由活的細菌培養的疫苗均可以促成癌症病變。這些細菌可以在人體潛伏數年而經由服用可體松、照射紫外線或是因為其它病菌的存在而引發癌症、肌肉硬化症，甚至於艾滋病。在過去的數十年間，已經有多次人們接種由活細菌培養之疫苗(包括感冒、黃熱病、天花疫苗等)，事後才發現疫苗本身被病菌感染的事件。這種事件通常都是科學家在發現某種新的病菌後，才發現原有的疫苗製造方式已被感染，而通常這種已感染的疫苗早已被廣泛地使用數年或數十年而不為人所知。這種已感染的疫苗中的病菌不止本身具有危險性，它們還可以自行結合或與疫苗的細菌結合而產生新的疾病，這些新的疾病即包括了癌症。
