過程
當它與皮膚、口腔和黏膜的傷口、膿液或汙物相遇時，立即分解生成氧。這種尚未結合成氧分子的氧原子，具有很強的氧化能力，與細菌接觸時，能破壞細菌菌體，殺死細菌。
影響
殺滅細菌後剩餘的物質是無任何毒害、無任何刺激作用的水。不會形成二次汙染。因此，雙氧水是傷口消毒理想的消毒劑。但不能用濃度大的雙氧水進行傷口消毒，以防灼傷皮膚及患處。
應用
此外，2%~3%的雙氧水經常會作為沖洗藥物而應用於口腔醫學。例如口腔內科的根管治療術，在擴大根管時，雙氧水經常與生理鹽水(0.9%氯化鈉溶液)一起交替使用。同時，雙氧水也是冠周沖洗的必備藥物之一。由於口腔內，絕大部分的感染是來自於厭氧菌，因此，雙氧水由於它的產氧作用，在口腔臨床醫學上的運用是十分廣泛的。
