1.血常規
周圍血白細胞總數正常或稍增多，以中性粒細胞為主。
2.X線檢查
支原體肺炎胸片無特異性，多為單側下葉浸潤，表現為節段性肺炎，嚴重者呈廣泛雙側肺炎。
3.病原學檢查
痰、鼻和喉拭子培養查肺炎支原體。
4.血清學檢查
血清病原抗體效價>1：32、鏈球菌MG凝集試驗，效價≥1：40為陽性，連續兩次4倍以上增高有診斷價值。
起病後2周，約2/3病人冷凝集試驗陽性，滴定效價大於1：32，特別是當滴度逐步升高時，有診斷價值。約半數病人對鏈球菌MG凝集試驗陽性。診斷的進一步證實有賴於血清中支原體IgM抗體的測定(酶聯免疫吸附試驗最敏感，免疫熒光法特異性強，間接血凝法較實用)。抗原檢測可用PCR法，但試劑藥盒還有待改進，以提高敏感性和特異性。
5.PCR技術
普通PCR技術檢測肺炎衣原體特異性DNA，具有快速、簡便、特異的優點，敏感性高於細胞分離技術，用套式PCR(nPCR)檢測可顯著提高其敏感性。
