妊娠試驗、胃鏡、纖維結腸鏡、彩色多普勒超聲、MRI、血清腫瘤標記物等，以及個別特殊情況下應用腹腔穿刺、腹腔鏡檢查、剖腹探查等。
1.腹腔鏡檢查可直接看到腫物的大體情況，可觀察整個盆腹腔，在可疑部位進行多點活檢並吸收腹液進行細胞學檢查可確定診斷及術後監護。但對巨大腫塊或粘連性腫塊患者禁忌施行，也無法觀察到腹膜後淋巴結。
2.放射學診斷MRI、CT等對腫瘤肝、肺及腹膜後淋巴結等轉移診斷有幫助。腹平片有助於腸梗阻的診斷。
3.其次若囊腫為惡性的卵巢腫瘤，和其他腫瘤一樣，能製造和釋放抗原，激素及酶等多種產物，這些物質在患者血清中可通過免疫學，生化等方法測出，稱為腫瘤標誌物，提示體內存在某種腫瘤。
