1、由於一些感染的問題，會引起甲狀腺的疾病的出現，像是細菌性引起或是病毒性引起的，都有可能引起甲狀腺疾病的發生，其中甲狀腺腫大又是常會出現的一個，所以要預防感染的一些問題。
2、長期的服用某些藥物也可能引起疾病的而出現，所以對於甲狀腺囊腫的疾病也不要亂吃藥物。還有自身的免疫不夠，易引發甲狀腺囊腫的出現，如毒性瀰漫性甲狀腺腫和慢性淋巴細胞性甲狀腺炎。
3、引起甲狀腺囊腫的先天因素，可能是某些酶的先天缺乏，在甲狀腺攝碘、碘與酪氨酸的結合、碘化配種2氨酸的耦聯以脫碘和碘的再利用等方面發生障礙，影響甲狀腺激素，TSH分泌增多，刺激甲狀腺增生腫大。
4、環境汙染，有時甲狀腺囊腫與環境因素的問題有很大的關係，像是百姓喝的飲用水被汙染了，這樣的因素就會導致一些疾病的發生，像是一些的廢水、廢物汙染飲用水源時也可以引起甲狀腺腫大。
5、由於身體吸取的碘減少，血中甲狀腺素濃度因之降低，通過神經—體液調節途徑，使垂體前葉分泌多量的促甲狀腺素，促使甲狀腺腫大，這種腫大實際上是甲狀腺的代償性腫大，是甲狀腺功能不足的現象。
