1.免疫和炎症反應 IPF的早期可能產生抗特異性免疫反應。下呼吸道的炎症反應是肺最早可檢查到的損害。間質和肺泡內的淋巴細胞、巨噬細胞和中性粒細胞增多。T淋巴細胞在 IPF的肺損傷和疾病進展的調節中起雙重作用。從IPF病人肺泡內獲得的T淋巴細胞呈激活狀態，可表達IL-2受體和分泌INF-γ。T淋巴細胞分泌的產物既可抑制成纖維細胞的增殖，也可增強成纖維細胞的膠原合成。此外，T淋巴細胞對B淋巴細胞也有巨大的輔助作用，這對增強免疫複合物的產生很為重要。
肺實質內特異性免疫反應的產生對影響肺組織的炎症細胞的集聚是很重要的。選擇性黏附分子、黏附分子結合素和免疫球蛋白在炎症細胞和內皮細胞的相互作用中都起重要作用。許多細胞的牢固黏附有賴於細胞間的黏附分子-1ICAM-1和白細胞作用抗原-1LFA-1。TNF-α在內皮細胞表面誘導 ICAM-1表達。血管外的白細胞包括LFA-1和血小板內皮細胞黏附分子是在白細胞和內皮細胞的連接處表達的。尿激酶型的纖溶酶激活物尿激酶u- PA可能是炎症細胞從血管到肺泡腔運動過程中不同組織的蛋白水解酶的降解產物。IPF的炎症細胞直接遷移依賴多種化學物質。趨化因子包括白介素 -1IL-1單核細胞趨化蛋白-1MCP-1、巨噬細胞炎症蛋白-IaMIP-1a、補體成分C5a、細胞因子MCP-1，MIP-1a、纖維連接素包括作用於巨噬細胞的RGD、白三烯B4LTB4、IL-8和作用於白細胞的C5a。T淋巴細胞、肺泡巨噬細胞、內皮細胞、上皮細胞、成纖維細胞是這些細胞因子的重要來源。尿激酶受體u-PAR，CD87對單核細胞和PMN是必需的趨化因子。U-PAR可能影響白細胞循環和激活補體受體 3的黏附功能。
2.損傷 上皮細胞損傷是IPF的標誌。病毒感染和炎症細胞產物氧自由基、蛋白水解酶是損傷的中介物質。上皮細胞損傷使血漿蛋白滲出到肺泡腔。在損傷過程中，肺泡基底層也可破壞。激活的炎症細胞淋巴細胞、巨噬細胞、PMN的存在使肺泡壁損傷持續發展。
3. 修復、纖維化 損傷肺泡的成功修復要求清除進入肺泡腔的血漿蛋白、替代損傷的肺泡壁、重新儲存損害的細胞外基質。在炎症反應時形成的肺泡滲出液包括許多細胞因子和介質如生長因子血小板生長因子、轉移生長因子-β、胰島素樣生長因子-I、纖維連接素、血栓素、纖維肽等。肺泡上皮細胞和巨噬細胞調節肺泡內纖維素的形成和清除。由於μ-PA的存在，肺泡腔內有網狀的纖維蛋白降解活動。然而，IPF病人BAL中的纖維蛋白降解活動由於纖溶酶原激活物和纖溶酶如纖溶酶原激活抑制物-1PAI-1的水平增高而受到抑制。同樣，肺泡腔內的纖維連接素也受到抑制。如果肺泡內的滲出液沒有被清除，成纖維細胞就會侵入、增生，產生新的基質蛋白，使富含纖維素的滲出液變成瘢痕。
花生四烯酸代謝在IPF的纖維化反應中也起重要作用。白介素對成纖維細胞和其他間質細胞產生直接的影響，刺激成纖維細胞釋放趨化因子、促進細胞增殖和膠原合成。肺泡修復的一個重要特徵為肺泡基底膜的上皮重新形成。為完成這一過程，Ⅱ型肺泡上皮細胞增生、最終基底膜表面修復、局部滲出液機化。這一過程無疑是在角化細胞生長因子和肝細胞生長因子的影響下發生的，這兩種因子調節上皮細胞的增生和移行。
在IPF的形成過程中，上皮細胞缺失，肺泡塌陷，當累及大量肺泡時便形成團塊狀的瘢痕。
當肺部發生纖維化時，機體自我應激反應會使肺泡上皮細胞分泌液體，從而表現出痰量增多，表現出呼吸困難，肺不張等症狀，因為纖維化，使肺表面張力改變引起。
