多肽大體上分為：多肽類藥物和多肽類保健品。
1.傳統的多肽類藥物主要是多肽類激素，近年來對多肽類藥物的開發已經發展到疾病防治的各個領域，特別是在以下各領域發展較快。
1.1抗腫瘤多肽 腫瘤的發生是多種因素作用的結果，但最終都要涉及癌基因的表達調控。現在已發現很多與腫瘤相關的基因以及對腫瘤產生作用的調控因子，篩選與這些基因及與調控因子特異結合的多肽，已成為尋找抗癌藥物的新熱點。如生長抑素已用於治療消化系統內分泌腫瘤;美國學者發現了一個能在體內顯著抑制腺癌的六肽;瑞士科學家發現一個能誘導腫瘤細胞凋亡的八肽。
1.2 抗病毒多肽 病毒通過與宿主細胞上的特異受體結合吸附細胞，依賴其自身的特異蛋白酶進行蛋白加工及核酸複製。因此可從肽庫內篩選與宿主細胞受體結合的多肽，或能與病毒蛋白酶等活性位點結合的多肽，用於抗病毒的治療。
1.3 多肽疫苗 多肽疫苗與核酸疫苗是目前疫苗研究領域內較受重視的研究方面之一，目前世界上對病毒多肽疫苗進行了大量的研究和開發。如1999年美國NIH公佈了兩種HIV-I病毒多肽疫苗對人體進行的臨床試驗結果;國外學者從丙肝病毒(HCV)外膜蛋白E2內篩選出一種多肽，它可刺激機體產生保護性抗體;美國正在開發瘧疾多價抗原多肽疫苗;宮頸癌人乳頭瘤病毒多肽疫苗已進入II期臨床試驗。我國在多種多肽疫苗研究方面也已做了大量的工作。
