急性咽炎的病因:
(1)病毒感染 以柯薩奇病毒、腺病毒、副流感病毒引起者多見，鼻病毒及流感病毒次之，病毒多通過飛沫和親密接觸而傳染。
(2)細菌感染 以鏈球菌、葡萄球菌和肺炎雙球菌為主，其中以A組乙型鏈球菌引起者症狀較重。若細菌或毒素進入血液，甚至發生遠處器官的化膿性病變，稱急性膿毒性咽炎。
(3)物理化學因素 如高溫、粉塵、煙霧、刺激性氣體等。
慢性咽炎的病因:
(1)局部因素 ①急性咽炎反覆發作轉為慢性。 ②上呼吸道慢性炎症刺激，如慢性鼻竇炎、鼻咽部炎症等，可因其炎性分泌物經後鼻孔流至咽後壁刺激粘膜，亦可因其使患者長期張口呼吸，引起粘膜過度乾燥而導致慢性咽炎。另外，慢性扁桃體炎、齲齒等亦可引起慢性咽炎。③長期菸酒過度，或受粉塵、有害氣體的刺激，均可引起本病。④職業因素(教師、歌唱者等)及體質因素亦可為本病誘因。
(2)全身因素 多種慢性病，如貧血、消化不良、反流性食管炎、心血管疾病、慢性下呼吸道炎症、肝腎疾病等都可引發本病。另外，內分泌紊亂、自主神經功能失調、維生素缺乏以及免疫功能紊亂等均與本病有關。
萎縮性咽炎的病因:
萎縮性咽炎常由萎縮性鼻炎蔓延而來，病因不明。
