嬰幼兒患菌痢時，隨體溫升高，可出現精神萎靡、嗜睡和煩躁，甚至驚厥，排便前每因腹痛而哭鬧不安。痢疾症狀常不典型，表現為腸功能紊亂，見消化不良性大便，排便時用力或面部脹紅提示裡急後重。
嬰幼兒痢疾症狀常不典型的原因，主要是消化系統特點和機體反應性差兩方面造成的。
消化系統特點：①消化系統發育不成熟，胃酸和消化酶分泌較少，消化酶的活性較低。對食物的耐受力差，不能適應食物質和量的較大變化。②因生長髮育快，所需營養物質相對較多，消化道負擔較重，經常處於緊張狀態。因此易於發生消化功能紊亂。
機體反應性差：①胃內酸度低(乳汁尤其是牛乳，使酸度更為降低) ，而且嬰兒胃排空較快，對進入胃內的細菌殺滅能力減弱。②血液中免疫球蛋白(尤指igm及iga)和胃腸道分泌型iga水平均較低。③正常腸道菌群對入侵的致病微生物有拮抗作用，新生兒出生後尚未建立正常腸道菌群。
基於上述種種原因，導致嬰幼兒痢疾症狀常不典型。
