1、種疾病的病原體不同。流感由流感病毒引起，流感病毒包括甲型、乙型和丙型三種;普通感冒可由多種病原體引起，如鼻病毒、腺病毒、細菌及支原體等，一般人在受涼、雨淋、過度疲勞後，因抵抗力下降時容易發病。
2、兩種疾病的臨床表現不同。與流感相比，普通感冒主要表現為打噴嚏、流鼻涕等上呼吸道症狀，全身症狀較輕，不發熱或僅有低熱，一般3至5天痊癒。流感的表現全身症狀較重，突然畏寒、發熱、頭痛、全身痠痛、鼻塞、流涕、乾咳、胸痛、噁心、食慾不振，嬰幼兒或老年人可能併發肺炎或心力衰竭。中毒型流感病人則表現為高熱、說胡話、昏迷、抽搐，有時可以導致人死亡。
流感治療的基本原則
1、離患者，流行期間對公共場所加強通風和空氣消毒。
2、及早應用抗流感病毒藥物治療：抗流感病毒藥物只有早期(起病1～2天內)使用，才能取得最佳療效。
3、加強支持治療和預防併發症：休息、多飲水、注意營養，飲食要易於消化，特別在兒童和老年患者更應重 視;密切觀察和監測併發症，抗生素僅在明確或有充分證據提示繼發細菌感染時方有應用指徵。
4、謹慎合理使用對症治療藥物：早期應用抗流感藥物大多能有效改善症狀，必要時可以聯合應用緩解鼻黏膜充血藥物、止咳祛痰藥物。兒童忌用阿斯匹林(或含阿斯匹林成分藥品)及其他水楊酸製劑，因為此類藥物容易與流感的肝臟和神經系統產生併發症即reye綜合徵相關，偶可致死。
