菠蘿裡有三種不好的成分1甙類，是一種有機物，對人的皮膚、口腔黏膜有一定刺激性。所以吃了未經處理的生菠蘿後口腔覺得發癢，但對健康尚無直接危害。
2羥色胺，是一種含氮的有機物，有強烈地使血管收縮和使血壓升高的作用，每100克果汁中含2.5毫克～3.5毫克。吃多後直接的反應就是頭痛。
3菠蘿蛋白酶，是一種蛋白質水解酶。提煉出來以後有很強的分解纖維蛋白和血凝塊的作用，在醫療上有用。菠蘿中的少量蛋白酶吃到胃裡後就被胃液分解破壞。但是有少數人對這種酶有過敏反應。吃後15～60分鐘左右出現腹痛、噁心、嘔吐、蕁麻疹(俗稱風疹塊)、頭痛、頭暈等症狀。嚴重的還會發生呼吸困難及休克。所謂菠蘿過敏就是指此而言。
預防方法：浸漬鹽水再吃在吃菠蘿前最好先要用淡鹽水泡一下，浸泡時間以半小時為宜，如果時間不夠長，菠蘿蛋白酶沒有完全破壞，時間過長，則會造成營養流失，還容易滋生細菌。
另外，也可以把果肉煮沸後放涼再吃。菠蘿蛋白酶在100℃加熱時90%以上都會被破壞，經煮沸後整體口味比泡鹽水更柔和，加點糖放在冰箱裡凍一凍口感會更好。
春吃菠蘿一天別超過半個菠蘿心炒菜竟有這功效
中醫認為菠蘿性微寒，吃多了容易傷胃腸，尤其是胃腸不好的人，多吃會引起腹瀉，一天最多不能超過半個。
人們在吃菠蘿時，常把菠蘿心扔掉，因為菠蘿心較硬口感不好，實際上，菠蘿心中的纖維含量要遠遠多於菠蘿表層的肉質，且粗纖維多，更有利於促進胃腸蠕動，增進身體的新陳代謝。
如果人們覺得口感較硬，可以把菠蘿心拿來炒菜，化油膩，增食慾，還增加膳食纖維的攝入。華南農業大學園藝學院果樹栽培系副教授胡又厘解釋，不是所有菠蘿心都能吃，未熟透菠蘿的心纖維顆粒太大，不好消化。買菠蘿時儘量挑選小一點、呈蛋黃色的。
