1、感染：即由於腐爛變質食物，寄生了各種細菌、病毒、真菌、原蟲及蠕動類寄生蟲，這樣的食物，通過口腔進入消化道，或腹部受冷熱刺激過強，使腸道內菌群失調，均可引起腹痛、腹瀉。
2、工作學習過度緊張、精神受刺激過強，可使胃腸道功能紊亂，發生腹瀉。此外，結腸過敏也可導致腹瀉。一些抑制交感神經、興奮副交感神經的藥物，也可導致腹瀉。
胃腸腫瘤和炎症：晚期胃癌、直腸癌、慢性胃腸炎、慢性潰瘍性結腸炎、腸克隆氏病等，都可引起急性、慢性的滲出性腹瀉。可見糞便中附有滲出液、粘液及膿血，排便次數增多，但糞便培養無致病菌生長。
3、腸對脂肪吸收不良：本類腹瀉糞便呈淡黃色或灰色，油膩糊狀，氣味惡臭。
4、一些腸系疾病如闌尾炎、憩室炎等可使結腸蠕動亢進而腹瀉;此外，類癌綜合徵分泌的血清素，肥大細胞增多病分泌的組織胺，胃泌素瘤分泌的胃泌素，甲狀腺髓樣癌分泌的前列腺素、血清素和低血鈣素等，都可使腸道蠕動增加，引起腹瀉。
5、中毒：食物中毒，以及細菌的外毒素引起的食物中毒，毒蕈中毒，河豚中毒等，引起腹瀉。砷、汞、酒精、四環素、紅黴素等化學物質中毒，也可引起腹瀉。牛奶、魚、肉、蝦、蟹過敏者，也可發生腹瀉。
